Single-cell integration in python with scanpy
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Single-cell integration in python with scanpy
Simple python single-cell dataset integration using a reference sample. This is an easy integration method that is suitable if you have similar samples. I also show how to compare the proportion of cells between samples and graph it in a simple example. Notebook: https://github.com/mousepixels/sanbomics_scripts/blob/main/simple_scanpy ...
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